VAddyはユーザーによって作成されたクロールデータをもとに検査(スキャン)を実行します。
クロールデータの中身はユーザーが検査対象Webアプリケーションを操作した際に送信されたHTTPリクエストそのままなので、そこにはUA(ユーザーエージェント)含まれます。
したがいまして、UAを判別してPCサイトとスマートフォンサイトに振り分けているようなWebサイトであれば、UAごとにクロールデータを作成してください。
クロールの実施方法
https://support.vaddy.net/hc/ja/articles/115005935107